Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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Ctdnep1Q3TP92 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Ctdnep1Q3TP92 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Ctdnep1Q3TP92 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ctdnep1Q3TP92 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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