Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Shroom4Q1W617 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Shroom4Q1W617 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Shroom4Q1W617 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Shroom4Q1W617 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Shroom4Q1W617 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms