Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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