Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
Hoxd1Q01822 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
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