| Hoxd1 | Q01822 | Gm44784-201 | ENSMUST00000207396 | 460 nt | TSL 5 BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm38405-203 | ENSMUST00000208548 | 400 nt | TSL 5 BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr638-201 | ENSMUST00000209757 | 966 nt | APPRIS P2 BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm6303-201 | ENSMUST00000210123 | 471 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm9068-201 | ENSMUST00000217393 | 455 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC133598.4-202 | ENSMUST00000225267 | 469 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Dynap-201 | ENSMUST00000025390 | 1227 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23928-201 | ENSMUST00000082469 | 145 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22304-201 | ENSMUST00000082688 | 129 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr203-201 | ENSMUST00000089305 | 924 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1369-ps1-203 | ENSMUST00000213922 | 3930 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Dnah12-201 | ENSMUST00000022433 | 12009 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm5798-201 | ENSMUST00000164613 | 1751 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm36960-201 | ENSMUST00000195491 | 2035 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm45176-201 | ENSMUST00000207696 | 4096 nt | BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14325-203 | ENSMUST00000188914 | 1494 nt | TSL 5 BASIC | 3.73 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr733-203 | ENSMUST00000214756 | 3640 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr360-202 | ENSMUST00000216706 | 1816 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn2r108-201 | ENSMUST00000167314 | 2568 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn2r-ps49-201 | ENSMUST00000173160 | 3551 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Pak3-201 | ENSMUST00000033640 | 8348 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr782-202 | ENSMUST00000213970 | 1944 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | 1810006J02Rik-201 | ENSMUST00000186473 | 1687 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1224-ps1-206 | ENSMUST00000216976 | 2019 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Snord66-201 | ENSMUST00000104051 | 75 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Zfp931-202 | ENSMUST00000108924 | 962 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14401-201 | ENSMUST00000108968 | 247 nt | TSL 5 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22032-201 | ENSMUST00000116946 | 116 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14558-201 | ENSMUST00000117458 | 381 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm4912-201 | ENSMUST00000122212 | 1044 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm15350-201 | ENSMUST00000135138 | 569 nt | TSL 2 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm16327-201 | ENSMUST00000137146 | 228 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm15323-201 | ENSMUST00000156109 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm26320-201 | ENSMUST00000157742 | 306 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm21788-201 | ENSMUST00000177878 | 543 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm26335-201 | ENSMUST00000178449 | 107 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23144-201 | ENSMUST00000180226 | 107 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mir6960-201 | ENSMUST00000183449 | 61 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm27660-201 | ENSMUST00000184028 | 208 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mir6382-201 | ENSMUST00000184055 | 110 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Obox4-ps39-201 | ENSMUST00000184306 | 628 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm27226-201 | ENSMUST00000184676 | 511 nt | TSL 2 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm27332-201 | ENSMUST00000184893 | 112 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm28390-201 | ENSMUST00000185212 | 700 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm28283-201 | ENSMUST00000185509 | 178 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Rpl23a-ps8-201 | ENSMUST00000186144 | 463 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm28785-201 | ENSMUST00000187478 | 379 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Ranbp2-ps12-201 | ENSMUST00000197110 | 386 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm42451-201 | ENSMUST00000197410 | 244 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm43645-201 | ENSMUST00000200129 | 341 nt | TSL 2 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm30484-201 | ENSMUST00000200327 | 449 nt | TSL 5 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm26691-203 | ENSMUST00000200444 | 479 nt | TSL 3 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm34811-201 | ENSMUST00000206580 | 445 nt | TSL 3 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm44654-201 | ENSMUST00000208052 | 329 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr546-ps1-201 | ENSMUST00000210328 | 326 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm29884-201 | ENSMUST00000218403 | 453 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC121286.1-201 | ENSMUST00000218811 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm36173-201 | ENSMUST00000219101 | 1163 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC157570.3-201 | ENSMUST00000219281 | 205 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC166358.10-201 | ENSMUST00000220556 | 144 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm7753-201 | ENSMUST00000221007 | 867 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm46369-201 | ENSMUST00000221577 | 401 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC154305.1-201 | ENSMUST00000224443 | 450 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC173482.1-201 | ENSMUST00000224494 | 3815 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Efcab9-201 | ENSMUST00000054327 | 754 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr744-201 | ENSMUST00000066457 | 1105 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | n-R5s94-201 | ENSMUST00000082573 | 119 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mir19a-201 | ENSMUST00000083482 | 82 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Snord38a-201 | ENSMUST00000083746 | 71 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Rpl26-ps2-201 | ENSMUST00000085379 | 435 nt | BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14308-201 | ENSMUST00000108990 | 1628 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1009-203 | ENSMUST00000216443 | 4047 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Btbd35f17-201 | ENSMUST00000105014 | 1960 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr617-202 | ENSMUST00000215755 | 3000 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Tom1l1-201 | ENSMUST00000020849 | 4308 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.72 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Ktn1-226 | ENSMUST00000191511 | 3962 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1293-ps-203 | ENSMUST00000217845 | 3628 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.81 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1500-204 | ENSMUST00000215760 | 2305 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Neurod4-201 | ENSMUST00000061571 | 3345 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Zfp131-201 | ENSMUST00000177916 | 3067 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Zfp583-206 | ENSMUST00000165705 | 1707 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm43259-201 | ENSMUST00000198446 | 3277 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm24374-201 | ENSMUST00000104394 | 106 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm16428-201 | ENSMUST00000121193 | 723 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14473-201 | ENSMUST00000122269 | 557 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23867-201 | ENSMUST00000122649 | 274 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm25386-201 | ENSMUST00000157814 | 288 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm25335-201 | ENSMUST00000158043 | 103 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22211-201 | ENSMUST00000158097 | 156 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm25606-201 | ENSMUST00000158363 | 95 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm11394-201 | ENSMUST00000181421 | 517 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm27718-201 | ENSMUST00000183721 | 86 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mir7074-201 | ENSMUST00000183884 | 63 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm7468-201 | ENSMUST00000203900 | 652 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm45209-201 | ENSMUST00000207122 | 353 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm37797-201 | ENSMUST00000212114 | 815 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm35548-201 | ENSMUST00000214348 | 441 nt | TSL 5 BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AL669916.5-201 | ENSMUST00000214874 | 361 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC159621.1-201 | ENSMUST00000223249 | 163 nt | BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Sprr2f-201 | ENSMUST00000050397 | 609 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.71 | □□□□□ -1.82 | | |