Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Pkp1P97350 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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