Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms