Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Spta1P08032 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Spta1P08032 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Spta1P08032 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Spta1P08032 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Spta1P08032 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Spta1P08032 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Spta1P08032 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Spta1P08032 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Spta1P08032 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Spta1P08032 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms