Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cops4O88544 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms