Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CntfrO88507 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CntfrO88507 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms