Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Spocd1B1ASB6 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms