Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms