Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms