Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Cln8Q9QUK3 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Cln8Q9QUK3 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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