Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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