Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SgshQ9EQ08 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SgshQ9EQ08 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.3 ms