Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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