Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NubplQ9CWD8 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms