Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SrrtQ99MR6 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.8 ms