Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Apobec3Q99J72 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Apobec3Q99J72 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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