Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.2 ms