Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms