Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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