Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms