Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms