Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rpl28P41105 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms