Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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BckdkO55028 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BckdkO55028 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BckdkO55028 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BckdkO55028 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BckdkO55028 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BckdkO55028 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BckdkO55028 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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