Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms