Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms