Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc170D3YXL0 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms