Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Grik3B1AS29 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms