Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Rtf1A2AQ19 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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