Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CtcflA2APF3 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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