Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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Rabgef1Q9JM13 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Rabgef1Q9JM13 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Rabgef1Q9JM13 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Rabgef1Q9JM13 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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Rabgef1Q9JM13 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Rabgef1Q9JM13 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Rabgef1Q9JM13 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
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Rabgef1Q9JM13 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Rabgef1Q9JM13 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Rabgef1Q9JM13 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Rabgef1Q9JM13 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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