Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RabggtaQ9JHK4 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms