Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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