Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Zbed3Q9D0L1 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Zbed3Q9D0L1 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms