Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Shmt2Q9CZN7 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms