Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rprd1bQ9CSU0 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms