Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ykt6Q9CQW1 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ykt6Q9CQW1 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms