Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms