Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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Tpm4Q6IRU2 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Tpm4Q6IRU2 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm4Q6IRU2 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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Tpm4Q6IRU2 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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Tpm4Q6IRU2 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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