Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trappc1Q5NCF2 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
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