Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Usp48Q3V0C5 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Usp48Q3V0C5 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Usp48Q3V0C5 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Usp48Q3V0C5 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp48Q3V0C5 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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