Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnf149Q3U2C5 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms