Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Srsf6Q3TWW8 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms