Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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