Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Sap25Q1EHW4 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms