Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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ptchd1Q14B62 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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ptchd1Q14B62 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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ptchd1Q14B62 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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ptchd1Q14B62 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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ptchd1Q14B62 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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ptchd1Q14B62 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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ptchd1Q14B62 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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