Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rpusd3Q14AI6 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rpusd3Q14AI6 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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