Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ubxn2bQ0KL01 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms